生信分析-microRNA与靶基因网络图

Demo结果

 

Demo结果解读

结果中显示了microRNA与mRNA之间的关系,图中microRNA调控的靶基因越多,说明microRNA影响了这一群靶基因的功能;靶基因被多个microRNA调控,说明该基因为核心的基因。

 

microRNA与靶基因网络图介绍

将显著性功能与显著性Pathway所包 含的靶基因取交集后与microRNA构建microRNA靶基因调控网络,可以在全局的水平上直观的反应基因之间的相互关系,同时反映了基因调控网络的稳定性。根据网络中microRNA的位置函数计算出microRNA在网络中的关系强度,即microRNA的网络特征值。特征值高 microRNA处于网络的枢纽性地位,该microRNA调控能力强,对网络结构和样本性状有重要的调控价值,同时从网络中也可以得到被 microRNA调控的关键靶基因。

 

分析要求

microRNA进行靶基因预测并且对靶基因进行筛选后。

 

提供结果

  1. 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
  3. 文本文件:microRNA与靶基因的关系,microRNA与靶基因的核心基因筛选。