生信分析-共表达网络图(Coexpression Network)

Demo结果

 

Demo结果解读

网络图为筛选出的核心基因之间的关系,通过图论的方法计算出关键基因,并通过关键基因的共表达基因预测出其功能。

 

共表达网络构建(Coexpression Network)

根据基因表达信号值的动态变化,计算基因间的共表达关系,得到基因间的表达调控关系及调控方向,从而构建基因的表达调控网络。利用共表达网络图,研究者可通过分析基因调控能力,获得样本随实验变化的核心调控基因。

 

分析要求

每组数据3个或3个以上生物学重复并且为差异基因或者关注的部分基因。

 

提供结果

  1. 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
  3. 文本文件:基因之间共表达相关性以及显著性,基因核心共表达的排序。