生信分析-时间序列的共表达网络

Demo结果

 

Demo结果解读

网络图为筛选出的核心基因之间的关系,通过图论的方法计算出关键基因,并通过关键基因的共表达基因预测出其功能。

 

时间序列的共表达网络介绍

根据基因表达信号值随着时间序列的变化,计算基因间的共表达关系,得到基因间的表达调控关系及调控方向,从而构建基因的表达调控网络。利用此网络图,研究者可通过分析基因调控能力,获得样本在时间过程中起调控作用的基因。

 

分析要求

时间,浓度,逻辑变化的样本的差异基因,趋势分析筛选的基因或关注的基因。

 

提供结果

  1. 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
  3. 文本文件:基因之间共表达相关性以及显著性,基因核心共表达的排序。