平台服务-转录组-PCR Array

RT2 Profiler PCR Array芯片介绍

PCR array是信号通路基础生物学研究和临床疾病研究的重要工具。这种功能分类芯片运用成熟的SYBR Green荧光定量PCR技术,专注于一个信号通路中基因的表达水平检测。与传统的高密度表达谱芯片相比,PCR array具有针对性强、灵敏度高、准确可靠等优点。阵列选择覆盖癌症、凋亡、信号转导、细胞因子、炎症反应、细胞毒理、药物代谢、干细胞及发育生物学、神经科学等方面。

美国SABioscience公司是Qiagen旗下子公司,目前,SABioscience公司针对不同的信号通路和疾病相关基因设计了150多款功能分类芯片,种属包括人、小鼠、大鼠、果蝇、猪、兔、鸡等,格式分为96孔和4 x 96孔两种,针对客户的需求,还有个性化定制芯片服务。上海伯豪生物技术有限公司是Qiagen公司的合作伙伴,能为您提供完善的功能分类基因芯片技术服务,您只需提供保存完好的样品,我们就可为您完成实验操作和数据分析。

一个典型的96孔功能分类基因芯片,一般包含84个目的待测基因,以及5个管家基因(HK),1个基因组DNA对照(GDC),3个反转录对照(RTC)和3个PCR阳性对照(PPC)。

 

技术优势

 

  1. 结果高度敏感性,精确性,可复制性:
    1)科学和完整的参照系统:
    对每个样本都设立了5个housekeeping gene (HKG)、genomic DNA contamination参照 、逆转录效率参照(RTC)、阳性PCR 反应条件参照(positive PCR control),确保了每一步实验的精确性符合发表q-PCR数据的国际标准MIQE。
    2)严格的质控过程:
    PCR Array三个步骤涉及的试剂,引物实验条件均经实验验证,确保均一和高度扩增 效率 (Aplification Efficiency 100%),特异性(单峰分离曲线),敏感性(1ng/96-well plate)和宽广的线性范围(wide dynamic range 108)
  2. 是操作简单,节约时间的即用型反应系统:
    在几个小时内一次性检测84 or 370个基因的表达水平, 所有实验条件均已设定,经过验证,无需优化条件。利用在线分析工具可以在15分钟内处理数千个Ct值,用户只需经过简单培训,在线分析网站:www.SABiosciences.com/pcrarraydataanalysis.php。
  3. 基因选择具有科学性和时效性,目标在于解决生物学问题:
    PCR Arrays上基因的选择过程。这些被选中的基因并不仅仅是简单的包括某个信号通路中的所有基因,所选基因必须对于相应的信号转导途径相当重要,并且是在mRNA水平上调控的。研发人员及生物信息学科学家通过阅读已发表文献, 从疾病发病,进展,治疗, 耐药性,等多方面入手。研发部门做了大量实验来证明所选基因的相关性。另外,我们与学术界的权威密切合作,所选的所有基因都通过了他们的认可。
  4. 产品应用广泛:
    有大于1000多篇文献引用了PCR Array数据,其中包括在Science,PNAS等杂志上发表的文献。 全球有1000多个实验室(包括300多个大学)在使用该产品,中国各地机构有北京/上海/武汉中科院, 中山肿瘤医院等。

 

目录产品列表(mRNA)

PCR array list_mRNA

 

服务流程

方案设计——合同签订与送样——样本抽提质检——反转录——PCR上机——数据分析

 

样本要求

  1. 样本类型包括mRNA、miRNA和DNA;
  2. 样本总量大于1μg;
  3. 无降解,无污染。

 

仪器平台

  • ABI 7900 HT Sequence Detection System