伯豪生物
单细胞核 RNA 测序

伯豪生物官网 www.shbio.com 最新消息 单细胞核转录组测序技术服务来了

伯豪生物单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是从组织抽提细胞核,然后在单个细胞核水平上对转录组进行高通量测序分析的一项新技术,通过检测单个细胞核的基因表达状态,进而揭示细胞间的异质性。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

技术流程

 伯豪生物单细胞核转录组测序科研流程图

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

冷冻样本和难消化样本的完美解决方案

1、适用于冻存组织样品;克服新鲜样品时效性限制;

2、适用于难以制备单细胞悬液的组织样品;

3、减少解离偏差,能更好地保留细胞类型多样性;

4、不需要酶促消化,真实反映细胞的组分。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

伯豪生物优势

1、高质量抽核:抽核经验丰富,针对不同组织优化了解决方案;

2、标准化内控:丰富的实操经验构建了标准化的内控体系;

3、流程化分析:完善的分析流程,准确快速解析单细胞核转录组数据;

4、专业化团队:资深的技术团队具有多年项目方案设计、实验操作、售后分析等经验;

5、全流程服务:提供组织抽核、单细胞核捕获、反转录、建库测序及数据分析的全套服务。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

送样要求

1、组织用量:黄豆粒大小 1 块;

2、样本处理:组织液氮速冻,-80℃保存;

3、质量要求:组织 RNA 无降解,RIN≥7;

4、运输方式:干冰运输。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

应用方向

冷冻样本;通过消化难拿到高质量的单细胞悬液的组织类型。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

结果展示

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 1

小鼠肝脏单细胞核

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 2

人松果体单细胞核

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 3

小鼠大脑皮层单细胞核

  伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 4

小鼠心脏组织细胞核 RNA 质检(RIN=8.9)

  伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 5

PCR 验证组织与细胞核、组织与消化细胞的差别(0 为完全一致)

结论: 小鼠大脑皮层,相比于消化细胞,细胞核的表达情况更接近于原始组织样本。

伯豪生物提供:单细胞核测序、单细胞核测序技术服务

【单细胞转录组测序】VS【单细胞核转录组测序】结果对比

1、随着测序深度的不断增加,单细胞核转录组测序(snRNA-seq)和单细胞转录组测序(scRNA-seq)得到的基因数相近。

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 6

Single-cell DropSeq scDropSeq


2、单细胞核转录组测序在细胞分群上与单细胞转录组测序没有区别

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 7

单细胞核数据分群结果                                     单细胞转录组数据分群结果

 

3、单细胞核转录组测序可有效挖掘稀有细胞类型

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 8

单细胞核转录组测序可以减少组织消化引起的偏差


4、单细胞核转录组测序结果中发现较少压力相关基因的表达

 伯豪生物单细胞核转录组测序数据图 9

参考文献

[1]Habib, Naomi, Avraham-Davidi, Inbal, Basu, Anindita, et al. Massively parallel single-nucleus RNA-seq with DroNc-seq[J]. Nature Methods, 2017, 14(10):955-958.

[2] Wu, Haojia, Kirita, Yuhei, Donnelly, Erinn L, 等。Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis[J]. Journal of the American Society of Nephrology, 2018.

-END-

更多伯豪生物服务咨询:

伯豪生物单细胞核转录组测序人工服务

上海伯豪生物技术有限公司