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单细胞核测序 | 干货测数据大放送!
发布时间:2021-01-28 浏览次数:421
利用自主研发的“伯优细胞核分离试剂盒”已经完成大脑皮层、下丘脑、海马、延髓、松果体、肝脏、心脏、胶质瘤、骨、乳腺和胰腺等20多种组织的抽核制备及上机测序。

细胞核 RNA 测序(snRNA-seq)的优势

1)冷冻组织可以用于直接抽提细胞核,为临床回顾性研究中单细胞测序的开展提供了解决方案。

2)有些组织通过酶解消化很难拿到高质量的细胞悬液,通过抽提细胞核,避开酶解消化,是一个更好的选择。

3)适用于对解离酶敏感(如神经元、肝实质细胞)、直径较大、形状不规则(如心肌细胞)等特殊细胞类型。

4)直接从组织抽提细胞核,不需要酶解消化及恒温孵育,避免了组织解离过程中诱导应激基因的表达。


伯豪生物丰富的单细胞核抽提经验

利用自主研发的“伯优细胞核分离试剂盒”已经完成大脑皮层、下丘脑、海马、延髓、松果体、肝脏、心脏、胶质瘤、骨、乳腺和胰腺等 20 多种组织的抽核制备及上机测序。

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伯豪生物 snRNA-seq 内测数据展示


1)脑组织

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脑组织 snRNA-seq 细胞类群注释结果

脑组织 snRNA-seq 各种细胞类型比例:神经元(Neurons)73.0%;星形胶质细胞(Astrocytes)9.4%;少突胶质细胞(Oligodendrocytes)9.2%;内皮细胞(Endothelial cells)6.7%;小胶质细胞(Microglial cells)1.4% 及嗅鞘胶质细胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。


2)心脏组织

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心脏组织 snRNA-seq 细胞类群注释结果

心脏组织 snRNA-seq 各种细胞类型比例:心肌细胞(Cardiomyocytes)38.8%;内皮细胞(Endothelial cells)30.3%;成纤维细胞(Fibroblasts)16.6;神经元细胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬细胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;间皮细胞(Mesothelial cells)0.6%;T 和 B 细胞分别占 0.4%;中性粒细胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪细胞(Adipocytes)0.2% 及髓细胞(Myeloid cells)0.1%。


3)肝脏组织

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肝脏组织 snRNA-seq 细胞类群注释结果

肝脏组织 snRNA-seq 各种细胞类型比例:肝细胞(Hepatocytes)56.0%;内皮细胞(Endothelial cells)10.9%;胆管细胞(Cholangiocytes)9.4%;成纤维细胞(Fibroblasts)9.2%;星状细胞(Stellate cells)8.7%;T 细胞 4.7% 及 B 细胞 1.1%。


伯豪生物优势

高质量抽核: 抽核经验丰富,针对不同组织优化了解决方案;

标准化内控: 丰富的实操经验构建了标准化的内控体系;

流程化分析: 完善的分析流程,准确快速解析单细胞核转录组数据;

专业化团队: 资深的技术团队具有多年项目方案设计 / 实验操作 / 数据分析的全套服务;

全流程服务: 提供组织抽核 / 单细胞核捕获、反转录、建库测序及数据分析的全套服务。


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