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lncRNA | > 5 分文章轻松 get
发布时间:2020-05-26 浏览次数:345
lncRNA的机制研究相当困难,主要实验过程复杂,实验量巨大,如果想发超10分的高分文章并且有好的研究思路可以从这个角度探索。其实我们可以换个角度研究lncRNA,不要将lncRNA作为一个调节分子;而是把lncRNA当做和mRNA一样的分子来研究。在体外,可以通过分子干扰手段,进行分子及表型研究;在体内,也是如此。两者通过各种组合,也能轻松get一篇5分以上的文章。

lncRNA

在之前的分享中小编给大家介绍过非编码 RNA 家族中的 circRNA , 如果说 circRNA 是目前生物学研究领域的流量担当,那 lncRNA 绝对是红遍大江南北了。从 lncRNA 历年文献发表情况和近十年国自然相关项目数据可以看出,lncRNA  在科研领域中热度年年攀升,并且高热不减。lncRNA  可以通过影响染色质结构和转录因子占位、表观遗传学、以序列和结构特异性结合生物大分子等机制调节基因表达,在发育、机体内平衡和维持细胞命运中发挥重要作用,lncRNA  的异常表达与包括癌症在内的多种疾病密切相关。随着高通量测序、lncRNA  芯片等技术的发展,越来越多的  lncRNA  被鉴定出来,但具体的作用与功能仍然不是很清楚,因此 lncRNA  的研究前景依然是十分广阔的,具有极大的研究价值。今天就与大家分享两篇新鲜出炉的 lncRNA 研究。


lncRNA 历年文献发表情况


近十年国自然 lncRNA 相关项目数据

文章展示

长非编码 RNA PGM5-AS1 通过削弱 miR-140-5p 介导的 FBN1 抑制,促进骨肉瘤细胞的上皮 - 间质转化,侵袭和转移

Long non-coding RNA PGM5-AS1 promotes epithelial-mesenchymal transition, invasion and metastasis of osteosarcoma cells by impairing miR-140-5p-mediated FBN1 inhibition

期刊:Mol Oncol

发表时间:2020 May 15

影响因子:5.962

单位:吉林省第一医院

摘要:骨肉瘤是一种罕见的骨肿瘤,近年来发病率升高,愈合率低;上皮 - 间质转化(EMT)是解释骨肉瘤和其他癌症的侵袭和转移的概念范例。因此,制定有效的治疗策略来治疗骨肉瘤的 EMT 是至关重要的。研究确定了长非编码 RNA(lncRNA)PGM5-AS1 在 EMT 和骨肉瘤进展中的分子机制;基于微阵列的分析用于筛选骨肉瘤相关的差异表达的 lncRNA;测定骨肉瘤组织和细胞中 PGM5-AS1 以及 microRNA-140-5p(miR-140-5p)和原纤维蛋白 -1(FBN1)的水平;荧光素报告系统确认结合片段,RNA  pull-down 实验和 RNA 蛋白免疫沉淀实验以验证 PGM5-AS1,miR-140-5p 和 FBN1 之间的关系。通过过表达、shRNA、模拟物或抑制剂改变 PGM5-AS1、miR-140-5p 和 FBN1 的表达,以探讨它们在体外如何调节骨肉瘤细胞的转移、侵袭和 EMT。在裸鼠体内采用功能丧失和功能增强的方法检测它们在体内肿瘤发生中的作用,发现骨肉瘤组织和细胞表达较低,但 PGM5-AS1 和 FBN1 表达较高;PGM5-AS1 与 miR-140-5p 竞争性结合以上调 FBN1。此外,阻碍 PGM5-AS1 和 FBN1 或过表达 miR-140-5p 在体外抑制骨肉瘤细胞的转移,侵袭和 EMT。此外,沉默 PGM5-AS1 或 FBN1 或过表达 miR-140-5p 显著抑制裸鼠体内的肿瘤发生。综上所述,PGM5-AS1 消耗导致 FBN1 减少,通过负调节 miR-140-5p 来延缓骨肉瘤过程。


PGM5-AS1 在骨肉瘤细胞过程中的调节机制


SMAD4 激活 Wnt 信号通路抑制颗粒细胞凋亡

SMAD4 activates Wnt signaling pathway to inhibit granulosa cell apoptosis

期刊:Cell Death & Disease

发表时间:2020 May 15

影响因子:5.595

单位:南京农业大学

摘要:TGF- β 和 Wnt 信号通路在许多细胞类型和组织中相互关联,并协调控制细胞功能。这篇文章中,报道了 TGF- β 信号通路的下游效应因子 SMAD4 诱导 Wnt 信号通路的受体 FZD4,建立了颗粒细胞(GCs) 中这两条通路之间的新的途径。研究者发现 SMAD4 是 FZD4 的强诱导剂,不仅启动 FZD4 转录,而且激活 FZD4 依赖的 Wnt 信号和 GC 凋亡。研究者确定了 SMAD4 促进 GC 中 FZD4 表达的直接和间接机制;SMAD4 促进 SDNOR 的产生,SDNOR 是一种新的 lncRNA,作为 miR-29c 的海绵,提供了另一种阻止 miR-29c 退化 FZD4mRNA 的手段。该研究不仅揭示了 TGF- β 和 Wnt 信号通路 SMAD4-FZD4 轴之间的一个新的串扰通道,而且为 GC 凋亡和卵泡闭锁的调控网络提供了新的见解:这些 RNA 分子,如 miR-29c 和 lnc-SDNOR,是治疗生殖疾病和提高女性生育能力的潜在靶点。


SMAD4 保护 FZD4 的原理模型

研究思路

前期高通量和数据分析,后期功能分子实验检验(敲除过表达、荧光素酶报告系统、染色质免疫沉淀等)。


lncRNA 机制研究如何 get 高分

lncRNA 的机制研究相当困难,主要实验过程复杂,实验量巨大,如果想发超 10 分的高分文章并且有好的研究思路可以从这个角度探索。其实我们可以换个角度研究 lncRNA,不要将 lncRNA 作为一个调节分子;而是把 lncRNA 当做和 mRNA 一样的分子来研究。在体外,可以通过分子干扰手段,进行分子及表型研究;在体内,也是如此。两者通过各种组合,也能轻松 get 一篇 5 分以上的文章。


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