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入股不亏!你必须 pick 的 circRNA
发布时间:2020-05-19 浏览次数:3764
近年来,非编码RNA(ncRNA)调控一直是生物学研究,特别是疾病研究的热点;包括miRNA、rRNA、tRNA、lncRNA和circRNA等多种未知功能的RNA。大部分的环状RNA是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于circRNA对核酸酶不敏感,所以比线性RNA更为稳定,这使得circRNA在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势,今天就与大家分享几篇circRNA领域的新研究。

近年来,非编码 RNA(ncRNA)调控一直是生物学研究,特别是疾病研究的热点;包括 miRNA、rRNA、tRNA、lncRNA 和 circRNA 等多种未知功能的 RNA。大部分的环状 RNA 是由外显子序列构成,在不同的物种中具有保守性,同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于 circRNA 对核酸酶不敏感,所以比线性 RNA 更为稳定,这使得 circRNA 在作为新型临床诊断标记物的开发应用上具有明显优势,今天就与大家分享几篇 circRNA 领域的近期研究。


文章展示

环状 RNA-ZNF532 调节糖尿病引起的视网膜周细胞变性和血管功能障碍

Circular RNA-ZNF532 regulates diabetes-induced retinal pericyte degeneration and vascular dysfunction

期刊:J Clin Invest

影响因子:12.282

单位: 复旦大学、南京医科大学

摘要: 糖尿病视网膜病(DR)是工作年龄成人视力丧失的主要原因。血管周细胞变性是 DR 的主要临床表现,但对周细胞变性的机制了解甚少。环状 RNA(circRNA)在多种生物学过程和疾病进展中起重要作用。该研究中,研究者调查了 circRNA 在周细胞生物学和糖尿病引起的视网膜血管功能障碍中的作用。在糖尿病应激下的周细胞中,糖尿病鼠模型的视网膜血管中以及糖尿病患者的玻璃体液中,cZNF532 的表达上调。cZNF532 沉默可降低周细胞的活力,增殖和分化,并抑制周细胞向内皮细胞募集。cZNF532 通过充当 miR-29a-3p 海绵并诱导 NG2,LOXL2 和 CDK2 的表达增加,进而调节周细胞生物学功能。降低 cZNF532 或 miR-29a-3p 的表达加剧了链脲佐菌素诱导的视网膜周细胞变性和血管功能障碍。相比之下,cZNF532 的过表达或 miR-29a-3p 的抑制可改善人糖尿病性视网膜病变引起的玻璃体和视网膜周细胞变性和血管功能障碍。该研究结果数据确定了 circRNA 介导的机制,可协调 DR 中的周细胞生物学和血管稳态。诱导 cZNF532 或抑制 miR-29a-3p 是治疗 DR 的一种可利用的治疗方法。


图示:cZNF532 在糖尿病视网膜病(DR)中功能机制示意图


环状 RNA-circBFAR 通过 miR-34b-5p/MET/Akt 通路促进胰腺导管腺癌的恶化

Circular RNA circBFAR promotes the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma via the miR-34b-5p/MET/Akt axis

期刊:Molecular Cancer

影响因子:10.679

单位: 中山大学孙逸仙纪念医院

摘要: 众多的研究表明,CircRNA 是癌症恶化的重要参与者,目前胰腺导管腺癌(PDAC) 中 CircRNA 的生物学过程和潜在机制尚不清楚。此研究中研究者通过 Sanger 测序验证 CircRNA,采用菌落形成、5-Ethynyl-2‘- 脱氧尿苷(EDU) 和 Transwell 法研究了 CIRCB FAR 对 PDAC 细胞体外增殖、侵袭和转移的影响。进行 RNA pull-down 测定以验证 circBFAR 与 microRNA miR-34b-5p 的结合。在研究中,发现了一种新的 CircRNA(circBFAR,hsa_circ_0009065),在 208 例 PDAC 患者队列中上调。circBFAR 的异位表达与肿瘤淋巴结转移(TNM)呈正相关,并且与 PDAC 患者的预后较相关性较差。此外,抑制 circBFAR 表达显着抑制体外 PDAC 细胞的增殖和运动及其肿瘤促进和体内模型中的转移特性。从机制上讲,circBFAR 还通过使 miR-34b-5p 海绵化而上调了间充质上皮转化因子(MET)的表达;circBFAR 过表达增加了 MET 的表达并激活了 Akt 的下游磷酸化(Ser 473),进一步激活了 MET / PI3K / Akt 信号传导途径,促进了 PDAC 细胞的恶化。重要的是,MET 抑制剂的应用可以显着减弱体内 circBFAR 介导的肿瘤发生。文章的研究结果表明,circBFAR 在 PDAC 的增殖和转移中起着重要作用,可将其作为 PDAC 的潜在预后标志物和治疗靶点进行探索。


图示:circBFAR 通过 miR-34b-5p/MET 通路促进 PDAC 增殖和转移 的提示机制


TDCIPP 暴露引起的 PC12 细胞 circRNA 表达谱的变化可能通过 Traf2 基因调节下游的 NF-κB 通路

Changes in the circRNA expression profile of PC12 cells induced by TDCIPP exposure may regulate the downstream NF-κB pathway via the Traf2 gene

期刊:Chemosphere

影响因子:5.108

单位: 天津医科大学

摘要: 磷酸三酯(1,3- 二氯 -2- 丙基)作为一种常用的有机磷阻燃剂(OPFR),已成为一种环境污染物。研究表明,TDCIPP 暴露具有许多毒性作用,如神经毒性,生殖发育毒性和内分泌紊乱。CircRNA 是环状非编码 RNA,已发现它们在多种疾病的发生中起重要作用。但是,尚不清楚 circRNA 是否在 TDCIPP 暴露诱导的细胞毒性中起作用。在此研究中,研究者分析了对照组和 PC12 细胞的 TDCIPP 暴露组的 circRNA 芯片结果,并检测到 3432 个差异表达的 circRNA(P<0.05),其中 TDCIPP 暴露组中 1682 个上调,1750 个下调。通过 qRT-PCR 验证 2 个上调的和 3 个下调的 circRNA 的表达水平,结果与芯片结果一致。然后,对几种 circRNA 进行 ceRNA 分析以预测可能的结合 miRNA 和结合位点。通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)途径分析分析靶基因。通过预测分析,发现 rno_circRNA_013845,rno-miR-361-3p 和 rno-miR-702-3p 可能参与 Traf2 表达的调节,从而影响下游 NF-kB 信号通路的表达并引起细胞凋亡。


研究思路

上面这篇文章使用的就是研究 circRNA 芯片常使用的一套研究思路:


技术路线图


可能很多人想问为何相似的研究套路也可以发高分的文章呢?就像开头所说,circRNA 可谓是热点中的热点,是目前生物学研究领域的流量担当,加上高端技术的加持,课题新颖,自然容易得到关注,高分文章也不在话下啦~


研究利器

Shbio ceRNA 芯片自推出以来,助力伯豪客户发表了多篇高分文章。来自天津平津医院的研究团队借助 Shbio human ceRNA 芯片 V1.0 筛选胶质母细胞瘤(GBM)中特异高表达的 circRNA/lncRNA,通过进一步的分子机制及功能研究发现 circNT5E 能够作为 miRNA-422a 的海绵吸附体,抑制其活性,进而影响胶质母细胞瘤的肿瘤发生。来自天津的另一研究团队利用 Shbio human ceRNA 芯片 V1.0 检测胃癌病人血浆外泌体中关键的 circRNA,通过一系列的研究发现外泌体中的 circRNA ciRS-133 可以通过靶向 miR-133/PRDM16 途径促进白色脂肪褐变。

 


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