生信分析-基因相互作用网络图

Demo结果

 

Demo结果解读

上图中节点的大小表示的是基因的degree,颜色代表上下调的信息,边的颜色或者线型代表是相互作用的来源。

 

基因相互作用网络图介绍

基因网络是一组基因的集合体,这些基因通过相互协作来控制生物体重要的生命过程。我们将客户关注基因进行基于实验验证,其他亲缘物种数据库检索、文献挖掘等多种信息进行基因互作网络的构建,找到关键核心基因。

 

分析要求

客户关注的mRNA(如差异基因)。

 

提供结果

  1. 图片文件(Network图),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打开进行细节调整;
  3. 文本文件:基因之间的互作关系,关键调节基因的排序(如betweenness centrality)。